Phylogenetischer Baum-Generator für Newick, FASTA und Taxa

Eine vollständige Newick-Zeichenfolge in den Newick-Modus einfügen und den Live-Baum prüfen. Der Parser erhält verschachtelte Topologie, Taxon- und Innenbeschriftungen sowie numerische Astlängen hinter Doppelpunkten. Das Ergebnis als SVG oder PNG exportieren oder Newick für die weitere Annotation in einem Phylogenetik-Werkzeug herunterladen.

Der Modus für alignierte FASTA eignet sich für kleine Sätze homologer DNA-, RNA- oder Proteinsequenzen gleicher Länge. Der Browser berechnet unkorrigierte paarweise Distanzen und erstellt einen UPGMA-Baum. Das Ergebnis dient als schnelle Distanzprüfung und ersetzt weder Alignment-Kontrolle noch Modellauswahl oder Maximum-Likelihood-Inferenz.

Im Artenlisten-Modus pro Zeile eine eindeutige Art, ein Gen oder ein Taxon eingeben. Der Generator ordnet die Beschriftungen als ausgewogenes Kladogramm für Unterricht, Arbeitsblätter oder Layoutentwürfe an. Ohne molekulare oder morphologische Merkmale leitet dieser Modus keine tatsächlichen evolutionären Beziehungen ab.

Ein phylogenetischer Baum kann evolutionäre Veränderung oder Zeit in seinen Astlängen codieren. Ein Kladogramm vermittelt nur die Verzweigungsreihenfolge. Beide können dieselbe Topologie zeigen, doch gleich wirkende Kladogrammäste haben keine quantitative Bedeutung. Vor der Interpretation von Distanz oder Divergenz den Maßstab und die Methodenbeschreibung prüfen.

SVG eignet sich als bearbeitbare Vektorgrafik für Zeitschriften, Abschlussarbeiten und Grafikprogramme. PNG ist für Folien, Dokumente und schnelles Teilen gedacht. Newick verwenden, wenn ein anderes Phylogenetik- oder Annotationswerkzeug Topologie, Beschriftungen und Astlängen als wiederverwendbare Baumdaten benötigt.

Baumerzeugung sowie SVG-, PNG- und Newick-Downloads funktionieren ohne Konto und Wasserzeichen. Eine Anmeldung ist nur erforderlich, wenn das erzeugte SVG zur Cloud-Speicherung und weiteren Bearbeitung an PaperBanana Studio gesendet wird. Lokales Parsing und direkter Dateiexport bleiben auf der Werkzeugseite verfügbar.

Newick-Parsing, Artenlisten-Layout, paarweise Distanzberechnung und UPGMA laufen bei der Kernerzeugung lokal im Browser. Für Vorschau und direkten Download werden die Eingaben nicht hochgeladen. Daten werden erst gesendet, wenn eine Cloud-Funktion wie das Öffnen des SVG in Studio ausdrücklich gewählt wird.

UPGMA eignet sich nur, wenn die Annahme annähernd konstanter Evolutionsraten zu den Daten passt und die Methode transparent berichtet wird. Für Publikationsaussagen Alignment-Qualität, Distanzkorrektur, Taxonstichprobe, Astunterstützung und Modellannahmen prüfen. Für komplexe Evolutionsgeschichten ist Maximum-Likelihood- oder Bayes-Inferenz oft angemessener.