Volcano-Plot-Generator für RNA-seq & Proteomik—ohne R oder Python

Benötigt werden eine Merkmals-ID, eine numerische log₂-Fold-Change-Spalte und eine Signifikanzspalte mit p-Wert, adjustiertem p-Wert, FDR oder q-Wert. Der Generator erkennt gängige Überschriften wie gene, symbol, protein, log2FoldChange, logFC, pvalue, padj, FDR und qvalue und zeigt die Zuordnung zur Prüfung an.

Bei Hochdurchsatzexperimenten sind adjustierte p-Werte oder FDR meist besser vertretbar, weil Tausende Merkmale gleichzeitig getestet werden. Verwenden Sie das Maß aus Ihrer statistischen Analyse und nennen Sie es in Achse, Bildunterschrift oder Methodenteil, damit Leserinnen und Leser den Grenzwert richtig interpretieren können.

Berechnen Sie sie vor dem Plotten mit einem geeigneten differentiellen oder statistischen Workflow. DESeq2, edgeR und limma erzeugen diese Spalten für Sequenzierungsdaten; Proteomik-Pipelines liefern vergleichbare Effekt- und Signifikanzfelder. Der Volcano-Plot-Generator visualisiert diese Ergebnisse, ersetzt aber nicht die zugrunde liegende statistische Analyse.

Kopieren Sie Merkmal, log₂-Fold-Change und Signifikanz aus Excel in das Datenfeld; Tabulatoren werden automatisch erkannt. Alternativ speichern Sie das Arbeitsblatt als CSV oder TSV und laden es hoch. Der Browser zeichnet die Abbildung ohne Installation von R, Python oder Kommandozeilenwerkzeugen.

Ein verbreiteter Ausgangspunkt ist |log₂FC| ≥ 1 und adjustierter p-Wert oder FDR ≤ 0,05. Die richtige Wahl hängt von Design, Power, Fachstandards und Analyseplan ab. Die Steuerelemente visualisieren Ihre Regel, wählen oder validieren das wissenschaftliche Kriterium aber nicht für Sie.

Jeder Merkmalsvergleich mit Effektspalte und gültiger Signifikanzspalte ist darstellbar. Als IDs eignen sich Proteine, Metaboliten, SNPs, miRNAs oder Screening-Treffer. Prüfen Sie fachspezifische Vorverarbeitung und Korrektur multipler Tests, bevor hervorgehobene Punkte als biologische oder klinische Kandidaten interpretiert werden.

SVG bewahrt editierbare Vektorpunkte, Text, Grenzlinien und Labels; PNG eignet sich für Dokumente und Folien. Prüfen Sie vor der Einreichung Breite, Schriftgröße, Farben, Bildunterschrift und Dateiformate des Zieljournals und gleichen Sie jeden geplotteten Wert mit der ursprünglichen Analyse ab.

Eingefügte und hochgeladene Tabellen werden lokal verarbeitet, sodass Quelldaten beim Plotten und Herunterladen das Gerät nicht verlassen. Sie werden nur dann an PaperBanana gesendet, wenn Sie ausdrücklich eine Kontofunktion öffnest, die ein bearbeitbares Projekt erstellt. Prüfen Sie vor Cloud-Bearbeitung die Datenrichtlinien Ihrer Institution.