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Heatmap Generator:从 Excel、CSV 和数据矩阵生成热图

使用 Heatmap Generator 粘贴 Excel 矩阵或上传 CSV/TSV,按行或列标准化,聚类相似模式,检查缺失值,并导出无水印 SVG、PNG 或排序 CSV,无需编程或注册。

粘贴 Excel 或上传 CSV/TSV按行或列进行 Z-score 标准化层次聚类与树状图无需编程、注册或添加水印

输入矩阵并选择热图设置

第一列填写行名,第一行填写列名;空白、NA、NaN、null 和“-”按缺失值处理。

可直接从 Excel 或 Google Sheets 复制,也支持逗号、制表符和分号分隔。

gene-expression.csv

矩阵有效。用于报告前请确认标准化、聚类和色标。

矩阵只在当前浏览器中解析、转换、聚类和渲染,本工具不会上传数据。

实时热图与方法摘要

8
行
6
列
0
缺失
-1.19–1.26
范围
标准化: row-z · 层次聚类: both · 距离指标: correlation

Z-score 使用总体标准差;层次聚类采用平均连接法,并使用所选欧氏距离或相关距离。

热图基础

数据热图展示什么

数据热图把二维矩阵中的每个数值映射为颜色,让高低值、相似模式和异常区域无需逐格读数即可被发现。

连续配色适合从低到高的数值,发散配色适合围绕零、基线变化或 Z-score 等有意义中点的数据。图例必须明确说明颜色代表什么。

聚类会重新排列行或列,使相似轮廓相邻;树状图记录该顺序,但不能独立证明生物学或因果分组。

01

矩阵

行和列定义要比较的观察或变量。

02

色标

图例把数值映射为颜色,并标出中点。

03

标准化

行或列 Z-score 会把问题从绝对量级转为相对模式。

04

聚类

距离指标和连接方法会把相似轮廓排列在一起。

方法与参考

让热图标准化与聚类可复现

缩放、距离、连接方法和颜色范围都可能显著改变热图,应在图注或方法中记录。

参考文档复核时间:2026 年 9 月

参考主题需要核对文档

参考

SciPy

主题

层次聚类

需要核对

核对树状图使用的距离指标、平均连接方法和叶节点顺序。

文档

linkage

参考

R stats

主题

标准化

需要核对

说明绘图前数值是否按行或按列进行了中心化和标准化。

文档

scale

参考

Matplotlib

主题

颜色映射

需要核对

选择符合数值含义且清晰可读的连续或发散色图。

文档

colormaps

方法标签有助于复现,但不能替代对分析代码和源矩阵的验证。

科研和数据分析热图示例

将任一示例载入生成器,检查原始矩阵、标准化、聚类顺序、缺失值和色标。

面向真实矩阵

用于基因表达、相关矩阵和 Excel 数据的热图

一个透明工作流覆盖探索分析、教学、报告和论文图件。

研究人员查看聚类基因表达热图

生物医学与组学研究人员

使用按行标准化和聚类比较基因、蛋白、代谢物、样本和治疗条件。

数据科学家检查相关矩阵热图

统计人员与数据科学家

显示相关矩阵、混淆矩阵和多变量特征,同时保留数值。

分析人员从 Excel 数据生成热图

Excel 与 CSV 分析人员

将电子表格矩阵直接转换为可分享图表和排序后的数据表。

Heatmap Generator 功能

面向 Excel、CSV 和聚类的热图制作功能

把带标签矩阵转换为可核查图表,同时保持每项转换可见。

粘贴 Excel 或上传 CSV/TSV

读取行列标签,保留缺失值,并在导出前报告意外的非数值内容。

使用 Heatmap Generator
热图生成器导入 Excel 和 CSV 矩阵

公开标准化与聚类算法

可选择原始值、行列 Z-score、欧氏或相关距离,以及行列聚类。

使用 Heatmap Generator
带行列树状图的热图聚类控制

无水印导出

下载可编辑 SVG、高分辨率 PNG 和与当前排序一致的 CSV。

使用 Heatmap Generator
热图 SVG PNG 和排序 CSV 导出选项
方法规则

标准化与层次聚类会怎样改变热图

同一矩阵经缩放或重排后可能讲出不同视觉故事,生成器会明确显示每项决定。

原始值

当所有行列单位可比且量级重要时保留原始数值。

按行 Z-score

逐行居中缩放,比较相对模式而非绝对量级。

距离

欧氏距离比较量级,相关距离强调轮廓形状。

平均连接

根据簇成员之间的平均成对距离合并聚类。

热图标准化和层次聚类方法说明
缩放改变数值,聚类改变顺序,两者都不会产生新的观察。方法可见

四步流程

如何从 Excel 或 CSV 生成热图

用四个透明步骤把电子表格矩阵转换为带标签、可导出的热图。

01

粘贴或上传矩阵

第一行放列标签,第一列放行标签。

02

检查缺失值

核对按缺失处理的单元格,并修正意外文本。

03

选择色标与聚类

设置标准化、配色、距离和要重排的维度。

04

导出图表和数据

下载 SVG 或 PNG,以及与当前显示一致的排序 CSV。

开始使用 Heatmap Generator
从 Excel 或 CSV 生成热图的四个步骤
将源矩阵和算法设置与导出图件一起保存。

继续分析

相关科研数据可视化工具

当问题涉及分布、效应量或演化关系时使用其他专用工具。

差异表达火山图

Volcano Plot Generator

在选择热图特征前查看差异表达效应量和显著性。

比较分组分布的箱线图

Box Plot Maker

比较热图中单个特征的分组分布。

带置信区间的森林图

Forest Plot Maker

汇总不同研究的效应估计和置信区间。

带物种标签的系统发育树

Phylogenetic Tree Generator

当距离矩阵表示物种时展示演化关系。

Heatmap Generator 常见问题

Heatmap Generator 常见问题

如何从 Excel 数据创建热图?+

从 Excel 复制矩形区域并粘贴到 Heatmap Generator。第一行保留列标签,第一列保留行标签;浏览器会自动读取制表符,把空白或 NA 保留为缺失值,并在矩阵有效后立即更新热图。

可以上传 CSV 或粘贴带标签的数据矩阵吗?+

支持粘贴逗号、制表符或分号分隔的矩阵,也可以上传 CSV、TSV 或 TXT。第一行用于列标签,第一列用于行标签;空白、NA、NaN、null 和短横线会保持为缺失值,不会被静默转换为零。

连续色标和发散色标有什么区别?+

当数值从低到高沿单一尺度变化时,使用 Viridis 或 Cividis 等连续色标;当数据围绕零、基线变化或 Z-score 等有意义的中点变化时,使用蓝—白—红发散色标。用于报告时应保留数值色条。

如何制作相关矩阵热图?+

准备一个行列使用相同变量的方形矩阵并粘贴或上传。保留原始相关系数,选择以零为中点的发散配色;需要同时查看精确系数时启用单元格数值。对称相关矩阵通常无需再次标准化。

热图应该按行还是按列标准化?+

比较每个特征在不同样本中的相对模式时使用行 Z-score;比较每个样本或条件内部的相对模式时使用列 Z-score。当所有单元格单位可比且绝对量级很重要时保留原始值,并在图注或方法中记录选择。

Heatmap Generator 支持聚类和树状图吗?+

可以聚类行、列或两者,并在重排后的矩阵旁显示树状图。工具采用平均连接聚合,可用欧氏距离比较量级差异,也可用相关距离比较轮廓形状;当前标准化、聚类维度和距离会显示在图表旁供复核。

Heatmap Generator 如何处理缺失值和导出?+

空白和常见 NA 标记以中性色显示,意外文本会计数提醒。解析、标准化、聚类和渲染都在浏览器中完成,不上传矩阵;可无需账户导出无水印 SVG、高分辨率 PNG 或排序 CSV,并将源矩阵与图件一起保存。

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在浏览器中生成热图

粘贴矩阵,选择标准化和聚类,核对色标,并与排序数据一起导出。

开始使用 Heatmap Generator