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免費支序圖產生器(Cladogram Maker)

用 Cladogram Maker 把二元性狀表畫成有標註的支序圖,或繪製你現有的 Newick 拓撲。你可以檢視共有分支、檢查衝突的性狀格,再匯出成生物作業、課程或實驗報告用的圖。免註冊。

性狀矩陣與 Newick各分支旁的性狀匯出 SVG、PNG、Newick 與 CSV無需註冊或浮水印

從性狀表到支序圖

從表格資料產生支序圖

貼上 CSV,或從 Excel 複製的表格:分類群放在列、性狀放在欄。0 代表祖先狀態,1 代表衍生狀態。上限為 30 個分類群、20 個性狀。

從範例開始

編輯性狀表
分類群
顯示選項

你的資料、樹狀計算與下載都留在此瀏覽器。無需帳號、點數或浮水印。

5 個分類群

你的支序圖

可檢視並下載
你的支序圖: 文昌魚, 七鰓鰻, 鯊魚, 青蛙, 小鼠

教學模型:每個衍生性狀只會出現一次,而且不會消失。性狀群必須是巢狀或彼此分離。這不是最大簡約法,也不是序列分析。

分成三個或更多分支的節點會保持未解析。分支長度不代表時間或演化改變。

檢視共有分支

其最小共有演化支中的所有分類群
青蛙, 小鼠
標註的共有衍生性狀
脊椎, 顎, 四肢

醒目標示的群組依共有節點判定,而非左右相鄰或分支長度。此功能檢視目前拓撲;不會建立生物學上的根。

檢查性狀證據
脊椎

具有此性狀的分類群: 七鰓鰻, 鯊魚, 青蛙, 小鼠

顎

具有此性狀的分類群: 鯊魚, 青蛙, 小鼠

四肢

具有此性狀的分類群: 青蛙, 小鼠

毛髮

具有此性狀的分類群: 小鼠

性狀相容性報告

未發現重疊的性狀集合衝突。這是在教學模型下檢查相容性,不代表生物學正確性。

還需要為論文製作科研插圖?

使用 paper banana,將研究方法、機制與流程轉成清晰的科研圖片。

什麼是支序圖?

支序圖是一種分支圖,用來表示生物之間關係的假設。末端是分類群,節點標示假設的分支點,而一個演化支包含共同祖先及其所有後代。共有衍生性狀(synapomorphy,即共同祖先出現、後代共同擁有的衍生性狀)有助於說明這些群組為何被歸在一起。

支序圖產生器會把相容的二元性狀表轉成教學用支序圖,或繪製你現有的 Newick 拓撲。此處分支長度不具定量意義。只給生物名稱清單,並不足以作為牠們演化關係的證據。

支序圖與系統發生樹:哪種工具適合你的資料?

使用此以性狀為基礎的支序圖建立工具來說明共有性狀與分支順序。若你已有含定量分支長度的樹,或要對已比對的 FASTA 進行基本 UPGMA 分析,請使用系統發生樹產生器。此 Cladogram Maker 的分支長度不代表時間或演化改變。

開啟系統發生樹產生器
概念性脊索動物支序圖,含文昌魚、七鰓鰻、鯊魚、青蛙與小鼠,作為 Cladogram Maker 教學範例。

使用可編輯表格探索支序圖範例

探索脊椎動物、陸生植物或未解析的關係。插圖用於說明概念;每張卡片會在工具中載入各自可編輯的教學矩陣。

為生物學打造

適合生物作業的線上支序圖製作工具

從你手邊的資料,製作成可解釋的圖。

概念性脊索動物支序圖,含文昌魚、七鰓鰻、鯊魚、青蛙與小鼠,作為 Cladogram Maker 教學範例。

學生:說明性狀表作業

貼上課程性狀表、選擇外群,並在繳交圖前檢視支持各分支的性狀。

綠藻、苔蘚、蕨類與向日葵以分支相連的植物學支序圖插圖。

教師:準備生物學學習單

載入植物範例矩陣,變更分類群或性狀名稱,並下載清楚的圖用於投影片或講義。

概念性昆蟲性狀矩陣與分支圖並列,說明性狀表輸入而非推論出的昆蟲系統發生。

講者:匯出可編輯的樹狀圖

帶入你自己的 Newick 拓撲並匯出乾淨的向量圖。SVG 文字與分支可在向量設計軟體中繼續編輯。

先有證據再裝飾

能說明每個分支的支序圖建立工具

讓分類群、共有性狀與產生的群組保持連結。

從性狀表建立支序圖

貼上 CSV 或 TSV 試算表資料。開啟表格編輯器重新命名分類群與性狀、切換 0/1 狀態,並新增列或欄。選擇全為 0 的外群,然後產生樹狀圖。

使用支序圖產生器
概念性昆蟲性狀矩陣與分支圖並列,說明性狀表輸入而非推論出的昆蟲系統發生。

檢查每個分支群背後的證據

矩陣模式會將巢狀或彼此分離的衍生性狀集合分組。標籤與證據清單顯示哪些分類群具有每個性狀。重疊且不相容的集合會產生實用的錯誤,而不是虛構的解析結果。

使用支序圖產生器
概念性脊索動物支序圖,含文昌魚、七鰓鰻、鯊魚、青蛙與小鼠,作為 Cladogram Maker 教學範例。

匯出可編輯的支序圖用於報告

下載 SVG 以進行向量編輯、PNG 用於投影片、Newick 用於交換拓撲,或 CSV 以保留矩陣。矩形與斜線版面只改變繪圖,不改變關係。

使用支序圖產生器
綠藻、苔蘚、蕨類與向日葵以分支相連的植物學支序圖插圖。

比較兩個分類群並醒目標示其共有演化支

在產生的樹中選擇任兩個分類群。檢視器會列出其最小共有群組中的所有後代,以及沿共有路徑標註的衍生性狀。開啟演化支醒目標示,了解螢幕位置為何不能決定親緣關係。

使用支序圖產生器
概念性脊索動物支序圖,含文昌魚、七鰓鰻、鯊魚、青蛙與小鼠,作為 Cladogram Maker 教學範例。

修訂矩陣前先找出衝突儲存格

相容性報告會找出每一對重疊且未巢狀的性狀,並顯示三個具名分類群及其 1/0、1/1 與 0/1 狀態,證明在此教學模型下確有衝突。將見證列匯出為 CSV,以檢視來源表格。

使用支序圖產生器
概念性昆蟲性狀矩陣與分支圖並列,說明性狀表輸入而非推論出的昆蟲系統發生。

三個步驟

如何從表格製作支序圖

從完整範例開始,再替換成你的課程資料。

  1. 概念性昆蟲性狀矩陣與分支圖並列,說明性狀表輸入而非推論出的昆蟲系統發生。

    01貼上性狀矩陣或匯入 Newick 文字

    貼上 CSV 或從 Excel 複製的表格,分類群在列、二元性狀在欄。將祖先狀態編碼為 0、衍生狀態編碼為 1,然後選擇全為 0 的外群。若已有已知拓撲,請切換到 Newick 並貼上樹狀文字。

  2. 概念性脊索動物支序圖,含文昌魚、七鰓鰻、鯊魚、青蛙與小鼠,作為 Cladogram Maker 教學範例。

    02產生樹狀圖並檢視共有性狀

    產生支序圖並檢視性狀標籤。選擇兩個分類群以檢視並醒目標示其最小共有演化支。若矩陣不相容,請檢視具名性狀對與三列見證,或在編輯來源資料前下載衝突報告 CSV。

  3. 綠藻、苔蘚、蕨類與向日葵以分支相連的植物學支序圖插圖。

    03自訂標籤並下載 SVG 或 PNG

    選擇矩形或斜線分支並調整標籤大小。下載 SVG 以進行向量編輯,或下載 PNG 用於投影片;匯出 Newick 取得拓撲,或匯出 CSV 取得矩陣。Newick 不會保留個別性狀標籤或樣式。計算與下載均在你的瀏覽器中執行。

使用支序圖產生器

更多生物學與圖表工具

延續你的生物學圖表工作流程

選擇相關工具,處理以序列為基礎的樹、遺傳圖或圖表編輯。

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開始前的問題

支序圖產生器常見問題

如何從表格或矩陣製作支序圖?+

在矩陣模式中,第一欄填寫分類群名稱,標題列填寫性狀名稱。祖先狀態填 0,衍生狀態填 1,選擇全零外群後產生支序圖。每種衍生性狀只出現一次,而且不會喪失;性狀集合必須是巢狀或彼此分離。

如何使用 Cladogram Maker 處理 Excel 資料?+

從 Excel 複製標題與資料列,將以 Tab 分隔的表格貼到輸入區,或貼上 CSV。每一列的儲存格數必須相同。分類群與性狀名稱須唯一,最多 30 個分類群與 20 個二元性狀。不支援直接上傳 XLSX。

自動支序圖製作工具如何處理衝突或不確定的性狀?+

自動支序圖製作工具要求已知的 0/1 狀態;請在產生前解決缺失或不確定的觀察。重疊且既非巢狀也非分離的性狀群會產生相容性報告,列出衝突性狀名稱。此工具不會猜測最佳樹、模擬重複獲得或喪失,也不執行最大簡約法分析。

除了物種名稱,簡單支序圖製作工具還需要哪些資料?+

簡單支序圖製作工具仍需要關係證據:含所選外群的二元性狀矩陣,或現有的 Newick 拓撲。物種名稱僅標示末端,不能決定演化關係。記錄性狀相同的分類群會保持未解析。可先從可編輯的動物或植物範例了解輸入格式。

這個免費線上支序圖製作工具可以下載什麼?+

這個免費線上支序圖製作工具會在瀏覽器中匯出 SVG、PNG、Newick 與矩陣 CSV,無需註冊、點數或浮水印。SVG 會保留文字與線條以供向量編輯。Newick 儲存拓撲與節點名稱,不保留性狀標註或樣式。另有一份 CSV 報告記錄不相容的性狀對。

什麼時候該用支序圖製作工具,什麼時候該用系統發生樹製作工具?+

使用此支序圖製作工具來說明分支順序與共有性狀,且不呈現定量分支長度。若你已有定量分支長度,或要對已比對的 FASTA 進行基本 UPGMA 分析,請使用連結的系統發生樹製作工具。請依資料與方法選擇;此支序圖繪製不會估計時間、演化距離或信賴度。

如何找出並醒目標示兩個分類群的共有演化支?+

在共有分支檢視器中選擇兩個不同的末端。它會在目前拓撲中找出其最小共有演化支,列出所有後代,並在矩陣模式顯示標註的共有衍生性狀。開啟演化支醒目標示後,SVG 與 PNG 匯出也會包含此標示。Newick 不提供性狀證據。

矩陣衝突報告如何協助我修正表格?+

對每一對不相容的性狀,報告會顯示三個實際分類群及其 1/0、1/1 與 0/1 狀態。這些見證列說明為何在單次獲得、無喪失模型下,性狀集合無法巢狀或彼此分離。下載 CSV 並檢查你的觀察;此工具絕不會自動變更資料。

從你的證據開始

用自己的資料製作支序圖

載入完整範例、檢查共有性狀,並為你的生物學工作建立清楚的分支圖。無需帳號。

使用支序圖產生器