Excel・CSV・データ行列対応のヒートマップ作成ツール

Excelで長方形の範囲をコピーし、ヒートマップ作成ツールに貼り付けます。先頭行に列ラベル、先頭列に行ラベルを入れてください。タブ区切りのセルは自動で読み取られ、空欄やNAは欠損値として保持されます。行列が有効になった時点でヒートマップが描画されます。

はい、できます。カンマ、タブ、セミコロン区切りのデータを貼り付けるか、CSV、TSV、TXTファイルをアップロードしてください。先頭行が列ラベル、先頭列が行ラベルになります。空欄、NA、NaN、null、ハイフンのセルは、ゼロに変換されず、欠損値として分かるように表示されます。

値が低から高へ一つのスケールで変化する場合は、ViridisやCividisなどの連続パレットを使います。ゼロ、基準値からの変化、Zスコアなど、意味のある中心がある場合は、青・白・赤の発散パレットを使います。結果を報告するときは、カラーバーを必ず表示してください。

先頭行と先頭列に同じ変数を並べた正方行列を用意し、貼り付けるかアップロードします。相関係数は生の値のままにして、ゼロが中点になる発散パレットを選びます。色とあわせて正確な係数を読んでもらいたい場合は、セルの値を表示してください。

各特徴量のサンプル間での相対パターンを比べたい場合は行Zスコア、各サンプルや条件内でのパターンを比べたい場合は列Zスコアを選びます。すべてのセルが比較可能な単位で、絶対的な大きさが重要な場合は、生データのままにしてください。選択した標準化は、図注または方法欄に記録します。

はい、対応しています。行、列、または両方をクラスタリングし、並べ替えた行列の横にデンドログラムを表示できます。大きさの違いにはユークリッド距離、プロファイルの形には相関距離を用いた平均連結法を使います。選択した標準化、クラスタリングの対象、距離は、確認用にグラフの横に表示されたままです。

空欄や一般的なNA表記は中立色の欠損値として表示され、想定外の文字列は確認用に件数が示されます。解析、標準化、クラスタリング、描画はすべてブラウザ内で行われます。編集可能なSVG、高解像度PNG、並べ替え済みCSVを、アカウントや透かしなしで出力できます。元の行列も図と一緒に保管してください。